Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc38A3KMP2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms