Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms