Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms