Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl41A2AUC9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl41A2AUC9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms