Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Upf2A2AT37 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms