Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramef17A2ASJ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms