Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms