Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb1A2AQ07 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb1A2AQ07 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms