Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Frmpd1A2AKB4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Frmpd1A2AKB4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms