Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lcn6A2AJB9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Lcn6A2AJB9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Lcn6A2AJB9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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