Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm12A2AJ77 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms