Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap5A2AGT5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap5A2AGT5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms