Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem185aA2AF53 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms