Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprfA2A8L5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms