Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd5A2A8L1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms