Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hivep3A2A884 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hivep3A2A884 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hivep3A2A884 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hivep3A2A884 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms