Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf19bA2A7Q9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Rnf19bA2A7Q9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Rnf19bA2A7Q9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Rnf19bA2A7Q9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Rnf19bA2A7Q9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Rnf19bA2A7Q9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rnf19bA2A7Q9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rnf19bA2A7Q9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Rnf19bA2A7Q9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf19bA2A7Q9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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