Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4bA2A432 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4bA2A432 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms