Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms