Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71e1A1L3C1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam71e1A1L3C1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms