Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms