Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4921501E09RikA0A0R4J054 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms