Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv31A0A075B5J5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv31A0A075B5J5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv31A0A075B5J5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv31A0A075B5J5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv31A0A075B5J5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv31A0A075B5J5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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