Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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