Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Catsperd-201ENSMUST00000112979 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rad54bQ6PFE3 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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