Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cspp1-201ENSMUST00000071087 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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