Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13397-201ENSMUST00000119562 878 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Lsm6-204ENSMUST00000146824 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Art2a-ps-201ENSMUST00000173420 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms