Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms