Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms