Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Otud1Q9CUB6 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Otud1Q9CUB6 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Otud1Q9CUB6 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Otud1Q9CUB6 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Otud1Q9CUB6 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Otud1Q9CUB6 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Otud1Q9CUB6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Otud1Q9CUB6 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Otud1Q9CUB6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Otud1Q9CUB6 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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