Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm16548-201ENSMUST00000133341 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm9825-201ENSMUST00000178598 843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm42871-201ENSMUST00000199333 315 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 1700008N11Rik-201ENSMUST00000209848 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm45538-201ENSMUST00000210771 1061 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 1700029F12Rik-201ENSMUST00000091377 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm43340-201ENSMUST00000200448 1344 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rhox12-202ENSMUST00000115146 561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm12004-201ENSMUST00000117869 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm29961-202ENSMUST00000215431 637 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm7125-201ENSMUST00000093430 273 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ccdc190-202ENSMUST00000175731 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm29388-201ENSMUST00000190718 284 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm37261-201ENSMUST00000194360 1101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 AC068459.1-201ENSMUST00000222492 905 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Taz-213ENSMUST00000135504 747 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 6330549D23Rik-202ENSMUST00000159536 1102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm6467-201ENSMUST00000171547 609 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm2324-201ENSMUST00000187464 662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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