Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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