Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms