Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms