Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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H2-Eb1P04230 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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H2-Eb1P04230 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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H2-Eb1P04230 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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H2-Eb1P04230 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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