Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Usf3B2RUQ2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms