Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lcn6A2AJB9 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms