Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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