Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms