Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm12700-201ENSMUST00000118145 457 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm15280-201ENSMUST00000126961 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ube4bos2-201ENSMUST00000154000 317 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm10045-201ENSMUST00000178657 483 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm32591-201ENSMUST00000203038 414 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 G6pc-201ENSMUST00000019469 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 CT572998.1-201ENSMUST00000219636 1557 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 BB014433-203ENSMUST00000179941 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm12188-201ENSMUST00000117387 310 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rspo4os-201ENSMUST00000152229 1281 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 2900076A07Rik-201ENSMUST00000180385 914 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm6073-201ENSMUST00000198253 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zfp410-208ENSMUST00000222258 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm12551-201ENSMUST00000122073 726 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Mrgpra3-201ENSMUST00000176369 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm8513-201ENSMUST00000182830 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm17868-201ENSMUST00000192761 668 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm7997-201ENSMUST00000210546 980 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 CT030664.1-201ENSMUST00000223639 908 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm33858-201ENSMUST00000216918 1411 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Pilra-202ENSMUST00000110980 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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