Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW9

Chtf18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, mousemouse

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Length 969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chtf18Q8BIW9 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Chtf18Q8BIW9 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chtf18Q8BIW9 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms