Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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