Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms