Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Hsd17b6-202ENSMUST00000219183 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tmem89-202ENSMUST00000192852 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 1810059H22Rik-202ENSMUST00000203662 546 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zfp640-201ENSMUST00000071320 894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Nectin3-205ENSMUST00000121245 953 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm7799-201ENSMUST00000133080 476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm14138-201ENSMUST00000122061 745 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm15788-202ENSMUST00000140087 751 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm8425-201ENSMUST00000171395 769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms