Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScaperF8VQ70 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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