Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms