Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl4Q9DCU6 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms