Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Lrrfip1-203ENSMUST00000097649 3645 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Rab23-202ENSMUST00000115174 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm7208-202ENSMUST00000212442 1627 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Mark1-201ENSMUST00000027929 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Zfp30-201ENSMUST00000032803 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm11489-201ENSMUST00000118342 499 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm20611-201ENSMUST00000177492 1131 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 H2-M1-201ENSMUST00000041662 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Smoc1-203ENSMUST00000129362 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Rc3h2-203ENSMUST00000112936 5828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Nedd4l-201ENSMUST00000080418 3326 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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