Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm14147-202ENSMUST00000178211 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Coq8a-208ENSMUST00000160879 561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm2939-201ENSMUST00000198496 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm45620-201ENSMUST00000209980 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm46391-201ENSMUST00000220704 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tollip-203ENSMUST00000130439 1892 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm15550-201ENSMUST00000120824 1748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Pdzk1ip1-201ENSMUST00000030488 1119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Phactr1-202ENSMUST00000110161 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm9974-201ENSMUST00000120357 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm24013-201ENSMUST00000157727 99 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Calr3-202ENSMUST00000109974 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm38095-201ENSMUST00000192896 1402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Snap47-201ENSMUST00000010038 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Cphx3-201ENSMUST00000163305 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpn1Q8CCS6 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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