Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 9030619P08Rik-201ENSMUST00000096397 857 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43119-201ENSMUST00000196957 2122 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nek11-201ENSMUST00000038648 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Psat1-201ENSMUST00000025542 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm10741-201ENSMUST00000218151 1748 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 C78197-201ENSMUST00000152781 3417 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nrf1-205ENSMUST00000115200 2491 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Atp9a-202ENSMUST00000109175 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms